平台简介

基因测序与分析平台,隶属于国家蛋白质科学研究(北京)设施清华基地,为生命科学研究提供基因组学与合成生物学解决方案。目前能够完成包括:全基因组从头测序、全基因组重测序、转录组测序、宏基因组测序、单细胞分选、单细胞转录组测序、目标区域测序、外显子测序、高通量寡聚核苷酸合成、基因合成、基因组合成等多个应用方向,已经为多个大型研究项目提供测序和信息分析服务。

目前已经拥有开放仪器包括:Illumina New Hiseq 2500(1T)测序仪、Fluidigm Biomark HD数字PCR仪、Fluidigm C1单细胞分选和测序系统、Oligo Array高通量寡聚核苷酸制备系统、Agilent Bravo自动移液工作站等。


基因测序分析系统(高通量测序仪)


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平台拥有的是Illumina公司最新版本的的高通量测序仪Hiseq2500,采用V4试剂能达到1T的数据量,并且时间比原来缩短1/3。Illumina的Hiseq测序平台是目前全球市场占有率最高,通量最高,认可度最高的高通量测序平台。Hiseq 2500是2012年底上市的最新型号,平台拥有的是其最新版本,具有几个突出的特点:通量高,费用低,应用广泛灵活,数据质量高,国际认可度高。

Oligoarray寡核苷酸芯片合成仪


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Oligoarray寡核苷酸芯片合成仪是用于在芯片上一次同时合成大量的寡核苷酸(一般为2000~720000条Oligo),合成后的寡核苷酸可以从芯片上剪切下来(化学剪切),这些寡核苷酸,根据使用者的设计,可以是引物序列,做为Oligo Pool,或者用于目标测序的全基因组外显子捕获,因此这些合成的Oligo可以是全基因组外显子引物序列-进行下游的全基因组外显子测序,也可以是设计的目标序列测序的引物-进行下游的目标序列测序。合成的这些寡核苷酸也可以是用来合成基因。


C1单细胞制备系统


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配备超低温探头,相比常温探头灵敏度高;可以运行1H/13C/15N/2H相关的各种实验;可以处理从低盐到高盐的各种盐浓度的样品。

BioMark HD微流控芯片基因分析系统


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Fludium公司的BioMark HD微流控芯片基因分析系统利用集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit,IFC)技术、实时荧光定量PCR技术与强大的基因分析软件相结合的技术平台。集成液体通路技术,即利用先进的集成工艺(光刻)在硅胶上刻上许多纳米级微管和纳米级微仓制成反应阵列,并通过独立的纳米级微型阀门控制溶液在阵列反应仓(Reaction Chamber)中的流动来实现生物样品的分液、混合、PCR扩增。并进行定量荧光检测,数据分析处理。可以实现高通量实时荧光

平台成员

yangxuerui

杨雪瑞

基因测序与分析平台主管 研究员

suyao

苏尧

工程师

xugang

徐港

博士后

fangjianhuo

方剑火

技术员

San Francisco

查艳

技术员

联系方式

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